美国政府关门加剧了美国空中交通管制系统的压力，导致航班大面积延误，并加剧了人们对员工福祉的担忧。交通部长肖恩·达菲强调了这场危机，称空中交通管制员因无薪工作和人员短缺而“压力重重”。美国联邦航空管理局 (FAA) 报告称，10 月 6 日至 7 日，超过 10,000 架次航班延误，到 10 月 8 日，航班中断数量已降至 3,200 架次，但伯班克、纳什维尔和纽瓦克等主要枢纽机场的航班延误仍在持续。FAA 指出，管制员的病假电话数量“略有增加”，这加剧了长期困扰该行业的人员缺口。据美国国家空中交通管制员协会 (NATCA) 称，目前仍有近 11,000 名持证管制员在岗，通常每周工作六天，每天工作 10 小时。
此次停摆迫使美国联邦航空管理局在多个机场实施流量控制措施，以防止人手不足的塔台超负荷运转。例如，10月6日，伯班克机场的控制塔台无人值守长达五个小时，迫使飞行员通过通用交通咨询频率（CTAF）自行协调降落。这种通常用于小型机场的临时系统导致航班延误超过两个小时。纳什维尔也出现了类似的问题，该机场进近设施关闭导致航班延误了两个小时。在纽瓦克自由国际机场，由于人手短缺引发流量限制，10月6日地面平均延误时间为53分钟。美国联邦航空管理局强调，此类措施优先考虑安全，但也凸显了该系统的脆弱性。
达菲批评了政治僵局，敦促国会恢复资金，以避免进一步的压力。他指出，空管员正努力应对财务不确定性，他们担心如果没有工资，他们将如何支付抵押贷款或日常开支。下一个预定的发薪日是10月14日，这对空管员来说是一个关键的考验，他们可能面临第一个无薪期。NATCA警告说，由于人员短缺和设备老化，长时间的中断可能会加剧延误和安全风险。
首席执行官埃德·巴斯蒂安此前曾批评美国联邦航空管理局依赖 20 世纪 60 年代的雷达系统，认为现代化对于解决导致延误的低效率问题至关重要。
为乡村机场航班提供补贴的基本航空服务 (EAS) 项目面临资金短缺，这可能会使依赖这些航线的社区陷入困境。该项目支持超过 17,000 个工作岗位和每日飞往偏远地区的航班，其中阿拉斯加被列为最脆弱的地区。如果没有资金，航空公司可能无法维持飞往这些地区的服务，从而加剧停摆带来的经济和物流影响。与此同时，依赖休假员工的网络安全和天气监测功能也面临缺口的风险，引发更广泛的安全担忧。
历史先例表明，情况可能会进一步升级。在2018-2019年为期35天的停摆期间，管制员因病缺勤的人数激增，引发了全国范围内的延误，最终迫使立法者恢复拨款。目前的趋势也反映了这一模式，管制员由于压力和财务紧张而缺勤的情况日益增多。专家警告称，随着停摆时间的延长，延误和取消的航班可能会增多，尤其是在人员短缺加剧的情况下。美国联邦航空管理局已加快招聘步伐，但同时警告称，解决现有的人员短缺问题需要时间。
由于延误情况难以预测，建议旅客密切关注实时更新。虽然美国运输安全管理局 (TSA) 维持了安检工作，但如果安检队伍持续缺席，预计安检队伍将更长。航空业正准备迎接进一步的挑战，航空公司正在调整运营，以缓解受影响枢纽的拥堵。截至10月8日，参议院尚未通过一项拨款提案，导致该系统处于岌岌可危的状态。
